南京雨花石盛产于雨花台、菊花台等地。据研究，上等的雨花石是一种玛瑙。
相传南朝梁武帝时，高僧云光法师在石子岗讲经，感动得上天落雨如花。花雨入地即变成无数大如鸡卵，小似蚕豆，绚丽多姿的砾石，雨花石由此得名，石子岗也改名雨花台。
雨花台所产雨花石，是经过流水搬迁作用而磨圆的各种砾石，主要成分是石英砂岩、石英岩、硅质岩、火成岩等坚硬的岩石和石英、玉髓、蛋白石一类的矿物。前者无鲜艳的颜色与光泽；后者即石英、玉髓等化学成分是二氧化硅。常见颜色有白、乳白、微黄色。也有红、紫、绿、蔷薇、黑色。还有一种由不同颜色条纹组成同心状、环状、斑点状的玛瑙。
一些珍奇雨花石瑰丽无比，朦胧的透明中似有山川云霞、花鸟鱼虫，鬼怪神仙，还有内中图案形同猪八戒、孙悟空的，更为世人赞誉。
人们常将雨花石“养”在水盂中，陈列案头，作为观赏之物。南京的民间艺人还将雨花石琢制成各种艺术品，天然人工合为一体。