新疆具有种植番茄的天然优势。与世界番茄主产区相比，产量稳定，谷维素含量高，可溶性固性物高，霉菌少、粘度好，病虫害及烂果发生少，红色素含量高于50毫克/100克，酱体深红而有光泽、细腻、均匀，调厚流散适度，酱味酸甜可口，富有鲜味。种植面积77万亩，产量347万吨，占全国的90％以上，约占世界番茄制品总量的15％，已成为全国加工番茄种植与加工规模最大、出口最多的生产基地。主要分布在昌吉、玛纳斯、呼图壁、吉木萨尔、石河子、奎屯、乌苏、博乐等县市。主栽品种有里格尔87-5、新番系列和石番系列等。从番茄的成熟果实中提取的番茄红素，是迄今为止自然界中被发现的最强抗氧化剂之一。科学证明，番茄红素清除自由基的

玉米是新疆仅次于小麦的主要粮食作物之一，种植面积1092万亩，总产量517.7万吨，单产474.1公斤/亩。全区各地均有种植。主要有饲用玉米、高赖氨酸玉米、高油玉米、甜玉米、爆裂玉米、糯玉米等。主栽品种有八农701、703；新玉10、14、24、31、33、43；伊单10、13、14号；石玉901等。

新疆小麦栽培历史悠久，是最主要的粮食作物之一。2011年，全疆小麦种植1616.9万亩，总产为576.6万吨，单产56.6公斤/亩。种植面积以喀什地区、昌吉州和伊犁州最大，分别达到321.2、267.9、267.1万亩。新疆小麦不仅高产，而且品质优良，蛋白质平均含量13.05%，高于全国平均水平，有普通小麦、密穗小麦、硬粒小麦、圆锥小麦、波兰小麦、东方小麦、新疆小麦等7个地方品种，其中新疆小麦为新疆所特有，大面积栽培的有“新冬”系列、“新春”系列以及引进新品种近五十个。

新疆山羊为肉、毛、绒、乳兼用地方品种，成年公羊平均体重32-59公斤，母羊28-34公斤；公羊产绒150-310克，母羊产绒175-184克；被毛长度在13.2-15.4厘米，最长可达到20厘米，平均单产390-590克和219-484克，净毛率75%以上；日均产乳量500-1000克；成年山羊平均胴体重为11.0-13.2公斤。全疆存栏191多万只。

博格达白绒山羊具有适于荒漠、半荒漠及山地草地四季放牧饲养，成年公羊平均体重48-50公斤，成年母羊28-30公斤；周岁公羊产绒量378克、周岁母羊347克，成年公羊657克（最高1570克），成年母羊452克（最高1260克），绒纤维直径12.7-13.7微米。全疆存栏10万只。

南疆绒山羊，具有耐干热、耐粗饲、绒毛品质好、适宜于荒漠、半荒漠地区饲养等优良特性。成年公羊平均产绒量440克，成年母羊平均产绒量330克，净绒率42-47%。南疆绒山羊原产于阿克苏地区，主要分布在塔里木盆地边缘，北疆地区也有饲养。全疆存栏120万只。

巴音布鲁克羊是新疆肉脂兼用型地方绵羊品种。起源于1771年蒙古族南路旧土尔扈特东归时期，经过土尔扈特南部蒙古族牧民经几个世纪传统游牧的孕育和现代畜牧科技手段（定向选育和本品种提纯复壮改良）有机结合而形成。成年公羊平均体重69.5公斤，成年母羊平均体重43.2公斤，当年羯羔体重30.4公斤，胴体重13.4公斤，屠宰率44.1%；成年羊体重63.25公斤，胴体重27.99公斤，屠宰率46.5%。主要分布在巴音郭楞蒙古自治州，中心产区在和静县。全疆存栏100万只。

和田羊是新疆优良地方品种属半粗毛羊品种。具有适应荒漠生态环境、抗逆性强、耐干旱炎热、耐粗饲、抗病力强等特性，羊毛是编制地毯和提花毛毯的优质原料。成年公羊体重50公斤，产毛量1.46公斤，母羊体重35公斤，产毛量1.2公斤。和田羊肉具有低脂肪、高蛋白、低胆固醇等特点。中心产区在和田地区昆仑山区。全疆存栏267万只。

哈萨克羊是新疆原始羊系之一，属肉脂兼用型粗毛羊品种。成年公母羊平均体重60公斤和40公斤。主产区在伊犁河谷，塔城、昌吉等地全疆存栏500万只。

中国美利奴羊（新疆型）是我国培育出的最好细毛羊品种。成年公母羊平均体重91.8公斤和43.1公斤，剪毛量16-18公斤，净毛率50%以上。毛长度9-12厘米,细度60～64支,主要分布在伊犁、塔城、博州、昌吉和阿克苏等地州，全疆存栏150万只。

新疆细毛羊以其产毛量、净毛率高、产肉多、繁殖力、适应性强、等特点而着称。成年公母羊可达体重143公斤和94公斤，产净毛6.09公斤和2.96公斤，羊毛主体细度为64支，毛长8厘米以上。主要分布在伊犁、博州、塔城、昌吉、巴州和阿克苏等地州，中心产区在伊犁和博州，全疆存栏584万只。

荷斯坦牛为大型乳用牛，体格高大，结构匀称，乳房大，乳静脉粗大，乳产量高，舍饲奶牛产乳量可达6500公斤，全疆各地都有分布，中心产区在天山北坡经济带及伊犁河谷、塔额盆地和焉耆盆地。全疆荷斯坦牛存栏82.8万头。

西门塔尔牛具有体大、肉多、乳蛋白率、乳脂率高、耐粗饲、易管理等特点，24月龄育肥公牛胴体重为605.3公斤，屠宰率达59.3%，22月龄母牛胴体重366.4公斤，屠宰率达55.4%。舍饲母牛年均产奶5722公斤，最高可达9000公斤以上。西门塔尔牛全疆各地都有分布，中心产区在南疆库尔勒阿克苏、喀什、和田等地。全疆存栏97.58万头，年出栏25万头。

塔里木鸽是由野鸽驯化选育而成的地方品种，具有较好的营养和药用价值，蛋白质含量高达19.7%，脂肪含量低，易消化。主要分布在喀什、和田、阿克苏等地。年存栏1200万羽，年出栏2500万羽。

新疆鹅俗称伊犁飞鹅、塔城飞鹅、灰鹅、草鹅、雁鹅，是我国唯一的一个灰雁驯化品种。鹅肉营养价值高，蛋白质、尼克酸含量高于鸡肉、鸭肉、牛肉；不饱和脂肪酸、氨基酸、赖氨酸等含量均高于鸡肉。鹅肥肝、血、胗等都有较高的营养价值，有的被制成医药产品。全疆存栏20万羽，年存栏6万羽，出栏15万羽，生产优质鹅肉约475吨。主要分布在伊犁河谷和塔城盆地。

珍珠鸡肉质细嫩，口味鲜美，营养丰富，是优质的野味肉禽。珍珠鸡富含人体所需要的氨基酸、蛋白质，含量高达23.4%，并含有较高的无机盐及微量元素，所含维生素比家鸡高一倍以上。年产珍珠鸡蛋40吨，年销售量40吨。存栏5000羽。

天山草鸡饲养环境位于新疆天山北坡的山间牧场和草原，采用半牧半饲的方式饲养，长年“饮天山雪水，吃野生虫草”，具有营养价值高，具备多种滋补功能。主要分布在昌吉州。存栏300万羽。

胡杨鸡是巴楚县农民将土鸡、肉鸡品种放养于天然胡杨林，通过其自由采食育成。主要以采食春尺蠖、蘑菇及草药为主。主要分布在巴楚县。存栏26万羽。

中华柴鸡具有耐粗饲、就巢性强和抗病力强等特性，主要为农户散养，以野外小虫、青草、草籽、杂粮为主食，肉质鲜美、低脂肪，比普通鸡肉胆固醇低40%，其中维生素、碘、硒、铁、锌等的含量比普通鸡高5－10倍，特别是柴鸡蛋含钙量高、富含氨基酸以及多种对人体有益的微量元素，柴鸡的鸡蛋黄呈金黄色和桔黄色，口感很有土味特色。主要分布在疏勒县、阿克陶县等地。存栏10万羽。

冰山玉珠黑鸡是当前国际国内最具有发展潜力的特禽品种，具有肉蛋兼用以蛋为主的特点。成年鸡体重1.5公斤左右，年产蛋210枚以上，蛋壳为深绿色、蛋清浓稠、蛋黄大、口感细嫩，蛋黄色素高、卵磷脂、维生素A、B、E、氨基酸的含量比普通鸡蛋高出5-10倍，蛋黄中的氨β球蛋白和γ球蛋白均高于其它鸡种。