瓜州种棉历史悠久，早在盛唐时期就从印度引进草棉进行种植，到七十年代开始大面积种植，进入九十年代， 围绕农业增效、农民增收，制定一系列惠农政策及措施，大力调整产业结构，多方寻求农民增收致富的新途径，不断提升棉花产业规模，棉花种植面积和单产逐年提高并趋于稳定。目前，棉花种植面积稳定在 20 万亩以上，占全县总播种面积的 65% 以上， 平均亩产皮棉 116 公斤 ，农民人均纯收入的 80% 棉来源于棉花种植，棉花种植已成为瓜州主导产业。
瓜州棉花产量高、品质优，平均水份 6.5 ％，杂质 1.6 ％，均低于国家标准；平均纤维长度 29.6mm ，比强度达 21.3gf ／ tex ，伸长率 7.7 ％，马克隆值 4.3 ，成熟系数 1.75 ，皮棉色泽白，品质好，深受纺织企业睛睐。生产产的皮棉、棉籽油、棉絮等产品畅销省内外，其中“丝路”牌棉絮获省优质产品奖。