文石是澎湖独有的美丽矿石，由多种矿物在特殊温度压力下产生化学变化所生成，长于玄武岩缝隙中，世界上仅澎湖与意大利西西里出产，西西里岛虽是文石富矿带，但品质不及澎湖所的文石。澎湖文石拥有丰富多变的美丽纹路，目前虽已明令禁采，但在马公市的文石店中，仍可买到各式各样的文石商品。

猫公石属玄武岩的一种，坚硬的石质上遍布海蚀粗孔，产于桶盘、虎井等玄武岩发达的离岛，为庭园造景的最佳材料。喜欢的人，可以至离岛海边寻觅一番。(澎湖县)

海树又名石帆或黑珊瑚、碧珊瑚，有金黄、墨黑、赭红三种颜色，多半是渔民捕鱼时从海中打捞而起，由于硬度比珊瑚差，价格也低得多；但是海树性寒，耐火度高，色泽恒久，为制造烟斗的最佳材料。目前澎湖最著名的一颗大海树，列在将军屿的天后宫中。(澎湖县)

澎湖曾为世界四大珊瑚产区之一，所产的珊瑚属粉红色系列，目前已停止开采，但市上仍有一些加工制成的耳环、项链、或小株珊瑚树装饰品等，游客可依喜好选购，不过珊瑚易碎、怕酸，应避免碰撞和接触汗水。(澎湖县)